甘蔗是用茎进行无性繁殖的作物，通常不用种子进行繁殖，不过如果是进行杂交育种等得到的甘蔗种子，保存过冬可以参考以下方法：
干燥处理
在收获种子后，要将种子放在通风良好、干燥的地方晾晒。一般种子的含水量要降低到一定水平，例如，将种子含水量控制在 10% 左右，这样可以降低种子的呼吸作用，减少能量消耗，同时也能抑制微生物的生长和繁殖。
避免在强光下暴晒，因为这可能会损伤种子的内部结构，影响种子的发芽率。
低温贮藏
可以将种子放在低温环境下保存，如放入冰箱的冷藏室，温度一般设置在 4 - 10℃左右。如果种子数量较多，也可以使用专门的种子冷藏库，这样能精准控制温度和湿度。
在低温环境下，种子的生理活动会显著减缓，包括呼吸作用、新陈代谢等，有助于延长种子的寿命。
密封包装
把种子放入密封袋或密封容器中，如可以使用厚实的塑料密封袋或者带有橡胶密封圈的玻璃容器。这样可以防止外界的水分进入，同时也能减少氧气的接触，避免种子因氧化而变质。
在密封袋或容器内可以放入干燥剂，如硅胶干燥剂，进一步吸收可能存在的微量水分。
如果是甘蔗茎（用来无性繁殖的部分）保存过冬，可以这样做：
窖藏法
选择在地势较高、排水良好、背风向阳的地方挖窖。窖的深度一般在 1 - 1.5 米左右，宽度在 1.5 - 2 米左右，长度根据甘蔗茎的数量而定。
在窖底铺上一层 10 - 15 厘米厚的细沙或干草，将甘蔗茎去除叶片和梢头后，捆成小捆，放入窖内。
摆放时，甘蔗茎之间要留有一定的空隙，方便通风。然后在甘蔗茎上覆盖一层厚约 20 - 30 厘米的干草或细土，最后用塑料薄膜覆盖密封，保持窖内温度在 4 - 9℃左右。
沟藏法
在田间挖沟，沟深约 30 - 40 厘米，宽约 40 - 50 厘米。将甘蔗茎平放于沟内，每放一层甘蔗茎，就覆盖一层薄土，土厚约 5 - 10 厘米。
一般可以堆放 2 - 3 层甘蔗茎，最上层覆盖的土要厚一些，约 15 - 20 厘米，并且要做成屋脊状，以利于排水。沟的两端要保持通风。